3. Slå ihop flera prover till en kollektion

Från de två föregående lektionerna vet vi att NMBS01.POS och NMBS05.POS är två prover som passar bäst ihop när deras första år (0) ligger precis över varandra.

Vi skall nu addera ihop dessa filer till en grupp eller collection och göra ett "medelvärdes-prov" eller medelvärdes-"sample" som alla prov-filer kallas i programmet.

Sedan skall vi passa ännu ett prov från Bergvik mot detta "medelvärdes-prov" och sedan addera det till gruppen (kollektionen).

1. Öppna NMBS05.pos och välj den som referens.

2. Öppna NMBS01.pos och kör först en korrelationsanalys för att kolla att filerna passar ihop.

Anmärkning: Du kan öppna flera filer på en gång: Håll ner kontroll-tangenten och klicka sedan på de filer du vill öppna. Klicka sedan på Open.

Klicka på "Collections" på menyraden och välj sedan "Create new collection". Den nya kollektionen väljs automatiskt som målgrupp (target collection) dvs när nya prov adderas till en kollektion så adderas de till just den här kollektionen.
Du har nu en tom korg att samla dina prover (samples) i.

Klicka högst upp på NMBS01.pos för att göra det till aktuellt (icke skymt) fönster.

Du kan också välja det via "Window" på menyraden som du ser på bilden ovan. Om du föredrar att jobba med maximerade fönster, så är det via denna meny som du skall växla mellan fönster!

Note: The Window command has been replace by WindowsList in later versions of CDendro!

Klicka på knappen "Add to target collection" (addera till målgruppen/målkollektionen)

Ett nytt fönster för inställning av offset (förskjutning) visas. Klicka på OK för att acceptera offset noll.

För att se vad som hänt, klicka högst upp i kollektionens fönster så att du kan se ditt prov i korgen!

Välj nu det andra provet NMBS05.pos och addera även det till kollektionen så att du har två prover i kollektionen! Även detta skall ha "offset" noll, eftersom vi vet att proverna är precis lika gamla och passar ihop i början.

Stäng sedan båda fönstren NMBS05 och NMBS01: Välj först respektive fönster genom att klicka högst upp på det, och klicka sedan på stängknappen (krysset) längst upp till höger i fönstret!

Du skall nu bara ha kollektionen öppen.

Anmärkning:Det fungerar tyvärr inte att bara klicka på stängknappen för ett fönster som inte är helt synligt. Du måste först välja fönstret, sedan stänga det!
Vi skall nu beräkna medelvärdena för dessa två prov.

Klicka på knappen "Create mean value sample"

Ett nytt "prov" har skapats. Det består av medelvärden av ringbredder och medelvärden av normaliserade data allt hämtat ur de två Bergviks-proven.
Vi kan kalla det för en mycket enkel referenskurva!

Här ser du "referens-kurvan" som en grupp röda kurvor baserade på medelvärden av normaliserade data från ingående prover - och som en grupp gröna kurvor baserade på medelvärden av ringbredder från ingående prover.

Den röda och den gröna kurvan i mitten av varje grupp med tre kurvor är medelvärdeskurvorna.
Kurvorna som ligger runtikring dessa är baserade på standardavvikelsen - inte av mycket intresse om medelvärdena kommer från endast två kurvor, men av större intresse när det är många prover i kollektionen!

Klicka på fliken "Workbench"!

Rapporten visar hur många olika ringbreddsvärden som använts för beräkning av varje årsmedelvärde.
Det fanns två årsvärden till de första 83 åren. Mellan 84 och 101 fanns det bara ett värde för varje år därför att det fanns fler årsringar i NMBS05.pos än i NMBS01.pos

Du skall nu addera ett tredje prov till kollektionen och sedan beräkna nya medelvärden.

Klicka på knappen "Select as reference", så att du kan passa (matcha) nästa prov mot detta medelvärdes-prov.

Öppna därefter nästa prov som finns i filen NMBS08.pos!

Klicka på knappen "Make corr. analysis" och kontrollera kurvpassningen! Klicka sedan på fliken "Workbench"!

Observera att detta prov passar bäst mot år 3 i referensen.

Klicka på knappen "Add to target collection", så hamnar det nya provet i "korgen"!

Du får nu fråga om vilket "offset" (förskjutning/avstånd) som skall användas när det tredje provet adderas till kollektionen.
Se till att det står 3 i fältet för offset!

Stäng fönstret NMBS08.pos!

Låt oss nu titta på listan över filer i kollektionen!

I Offset-kolumnen ser du vilka relativa år som täcks av data från motsvarande medlemsfil.

Om du vill ta bort en medlem ur kollektionen, välj den genom att klicka på den och klicka sedan på knappen Delete member!

Du kan knyta en kommentar till en medlem: Välj den genom att höger-klicka på rätt rad så öppnas ett litet fönster! Här kan du också ändra "offset-värdet". (Det som är 0, 0 och 3 på bilden.)

Spara nu kollektions-filen. Använd namnet NMBS1_5_8.fil (Klicka på "Collections" på menyraden, därefter på "Save collection As"). Stäng den sedan.

Stäng även andra filer som är öppna.

Anmärkning: En kollektion kan sparas antingen som en kollektions-fil med filändelsen .fil eller som en decadal-fil (filändelsen .rwl eller .fh (Heidelberg-formatterad)).
En collectionsfil (.fil) innehåller bara filnamn, kommentarer och "offsets" - INGA ringbreddsdata!
När du sparar en collection i en .rwl-fil så får du en fil som innnehållar alla ringbreddsdata i samma format som filerna i ITRDB. (International tree ring data bank i Arizona) Filerna i ITRDB brukar dock inte innehålla kommentarer även om det formellt är tillåtet. Du har två kommandon i menyn för att skriva en fil i decadalformat, i det ena fallet läggs kommentarerna in i .rwl-filen, i det andra fallet skrivs kommentarerna in i en separat .txt-fil. Mer om decadal-formatet i en följande lektion.

Anmärkning: När du sparar ett "medelvärdes-prov" som skapats ur en kollektion med knappen "Create mean value sample" så kan du spara det antingen som normaliserade medelvärden (.d12-format) med standardavvikelser och ringbredder med standardavvikelser eller som enbart medelvärden av ringbredder i ett av tre möjliga format - .wid, .rwl eller .fh

Det finns tre olika sätt att få upp en medelvärdeskurva med standard-avvikelser på skärmen:
1. Öppna en normaliserad (.d12) fil som lagrats från en medelvärdeskurva.
2. Öppna en kollektion "Open collection (.fil)" med alla sina medlemmar och klicka på knappen "Create mean value sample"
3. Använd kommandot Collections/Create new collection from decadal or Heidelberg file, klicka sedan på "Create mean value sample"
4. Använd kommandot Collections/Create reference curve from big decadal file (.rwl eller .fh).

Anmärkning: I tidiga versioner av CDendro användes ".dec" som filändelse för decadal-filer. När filändelsen ".rwl" infördes i CDendro så bibehölls ändå möjligheten att öppna gamla filer med ändelsen .dec.

See also the section on Multi-radii collections, i.e. when several radii are taken from the same trunk.


Copyright © 2011, Cybis Elektronik & Data AB, www.cybis.se